โลกอนาคตอันใกล้ องค์กรก่อการร้ายลึกลับนาม "คอบร้า" ขโมยอาวุธชีวภาพสุดอันตรายที่สามารถทำลายล้างมวลมนุษยชาติ กองกำลังพิเศษระดับสูง "จีไอโจ" จึงถูกเรียกตัวมาปฏิบัติภารกิจสุดระห่ำเพื่อตามยึดอาวุธคืน ดยุคและริปคอร์ดนำทีมทหารชั้นยอดเข้าปะทะกับเดสโตรและสตอร์มชาโดว์ในศึกที่ดุเดือดทั้งทางบก ทางอากาศ และใต้ทะเล การต่อสู้ครั้งนี้จะชี้ชะตาว่ามนุษยชาติจะรอดพ้นจากเงื้อมมือคอบร้าหรือไม่
