สามปีหลังเหตุการณ์ที่เกาะอิสลานูบลาร์ ภูเขาไฟใต้น้ำใกล้ปะทุจนอาจล้างล้างเผ่าพันธุ์ไดโนเสาร์ทั้งหมดทั้งมวล โอเวน แกรดดี้ และแคลร์ เดียริง จึงกลับไปยังเกาะเพื่อช่วยเหลือสัตว์ดึกดำบรรพ์เหล่านี้ก่อนที่พวกมันจะสูญพันธุ์อีกครั้ง แต่ภารกิจกลับพลิกผันเมื่อพวกเขาพบว่ามีกลุ่มคนที่วางแผนใช้ไดโนเสาร์เป็นอาวุธสงคราม การต่อสู้เพื่อความอยู่รอดของทั้งมนุษย์และไดโนเสาร์จึงเริ่มต้นขึ้นในสถานการณ์ที่ไร้ทางเลือก
