ฝูงสัตว์จากสวนสัตว์เซ็นทรัลพาร์คกลับมาพบกันอีกครั้งในยุโรป หลังจากการผจญภัยในแอฟริกา อเล็กซ์ผู้เป็นสิงโต มาร์ตี้ม้าลาย กลอเรียฮิปโปโปเตมัส และเมลแมนยีราฟ ต้องหาทางกลับบ้าน แต่กลับถูกหน่วยควบคุมสัตว์ของฝรั่งเศสนำโดยกัปตันดูบัวส์ไล่ล่าอย่างไม่ลดละ พวกเขาจึงต้องปลอมตัวเป็นนักแสดงละครสัตว์ในคณะละครสัตว์เร่ร่อนเพื่อหลบหนี การแสดงที่เต็มไปด้วยสีสันและความสามารถพิเศษของพวกเขาทำให้คณะละครสัตว์ได้รับความนิยม แต่การตามล่าของดูบัวส์ก็ยิ่งเข้มข้นขึ้นเรื่อยๆ
