คลาร์ก เคนท์ต้องเผชิญหน้ากับอดีตที่ถูกจารึกไว้ในซากยานคริปโตเนียน ขณะที่ซูเปอร์แมนกำลังตามล่าหาความจริงเกี่ยวกับต้นกำเนิดของเขา การปรากฏตัวของคาร่า น้องสาวต่างดาวที่ถูกส่งมาปกป้องเขากลับสร้างความวุ่นวายให้กับสมอลวิลล์ ในขณะเดียวกันเล็กซ์ ลูเธอร์เริ่มสะสมอำนาจและเปิดปฏิบัติการลับที่อาจเปิดโปงความลับของคลาร์ก ความสัมพันธ์ของคลาร์กกับโลอิสและโคลอี้ถูกทดสอบเมื่อศัตรูเก่าและใหม่รวมตัวกันเพื่อโค่นล้มเขา
